Em 1954 ocorre a doação do terreno na Praça da Independência para a construção do Santuário. O projeto foi confiado ao arquiteto Benedito Calixto de Jesus Neto, neto do renomado artista plástico Benedito Calixto e também arquiteto responsável pelo projeto e execução do segundo maior santuário mariano do mundo, em Aparecida. Em 1955 é levantado o Cruzeiro na Praça da Independência que, do alto, continua até hoje a velar pelos devotos de Maria. A construção do Santuário é iniciada em 1956. No forro, em estilo basilical, existem quatro trabalhos em alto relevo de dois metros quadrados cada um e no centro está o emblema da Congregação dos Padres da Doutrina Cristã. Antes da construção do santuário a paróquia funcionou na Igreja de São Francisco. No dia 8 de setembro de 1956, foi colocada no Santuário, solenemente, uma pedra relíquia extraída dos alicerces da Basílica de São Pedro, em Roma, doada e benta por sua Santidade o Papa  Pio XII. Em 09 de julho de 1978 foi inaugurado o campanário de 48 metros e o sino de bronze pesando 3.000 quilos. Na celebração jubilar dos 2000 anos do Nosso Senhor Jesus Cristo, o Santuário foi escolhido como Catedral da nova diocese que surgia, a diocese de Catanduva. A diocese abrange 17 cidades, 33 paróquias e cerca de 40 sacerdotes (entre seculares e religiosos). Até 2004 ficou aos cuidados dos padres doutrinários, hoje está sob responsabilidade dos padres diocesanos.